Theo đó, sau khi đang thụ lý điều tra vụ án Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng xảy ra tại Công ty Cổ phần Hóa dầu và Xơ sợi Dầu khí (PVTEX) và các đơn vị có liên quan theo Quyết định khởi tố vụ án hình sự số 32/C46-P12 ngày 16/6/2017, Cơ quan Cảnh sát điều tra, Bộ Công an đã ra Quyết định khởi tố bị can số 238/C46-P12 và ngày 26/6/2017 ra Quyết định truy nã đặc biệt toàn quốc số 15/C46-P12 đối với Vũ Đình Duy về tội Cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng.
Theo quyết định khởi tố, Vũ Đình Duy, sinh năm 1975, Nguyên Tổng Giám đốc Công ty Cổ phần Hóa dầu và Xơ sợi Dầu khí, Tập đoàn Dầu khí Việt Nam, đã bỏ trốn từ ngày 22/10/2016.
Vũ Đình Duy từng giữ chức Tổng giám đốc Công ty CP Hoá dầu và Xơ sợi Dầu khí (PVTex) từ ngày 15/7/2009 đến tháng 2/2014.
Sau khi bị giáng xuống chức Phó Tổng giám đốc PVTex vì công ty thua lỗ hàng ngàn tỉ đồng, Vũ Đình Duy được bổ nhiệm làm Phó giám đốc Sở Công thương Hải Phòng (từ tháng 12/2014 đến tháng 6/2015). Tiếp đến, Vũ Đình Duy được bổ nhiệm giữ chức cục phó Cục Kỹ thuật an toàn và Môi trường công nghiệp của Bộ Công Thương.
Cuối cùng, Vũ Đình Duy được điều động và bổ nhiệm về Vinachem hồi giữa tháng 4 năm 2016, chỉ một ngày trước khi Bộ Công Thương có Bộ trưởng mới thay ông Vũ Huy Hoàng. Ủy viên Hội đồng Thành viên (HĐTV), Phó Tổng giám đốc Tập đoàn Hóa chất Việt Nam (Vinachem) cho biết, việc bổ nhiệm Vũ Đình Duy làm thành viên HĐTV Vinachem hồi tháng 4/2016 là do Bộ Công Thương có văn bản gửi xuống tập đoàn đề nghị thực hiện việc bổ nhiệm cán bộ.
Vũ Đình Duy bắt đầu vắng mặt tại cơ quan Vinachem từ ngày 24.10.2016. Ông Duy sau đó có 2 đơn xin nghỉ ốm gửi lãnh đạo tập đoàn, trong đó đơn ngày 31/10/2016 nêu lý do “xin nghỉ để đi nước ngoài chữa bệnh”. Sau nhiều lần liên lạc bất thành, Vinachem đã gửi văn bản báo cáo chính thức tới Bộ Công Thương vào ngày 2/11/2016.
Ngày 1/12/.2016, Vũ Đình Duy bị Ban cán sự đảng Bộ Công Thương áp dụng hình thức kỷ luật buộc thôi việc, đồng thời tiến hành khai trừ đảng đối với ông Duy.
