Thứ trưởng Phan Thị Mỹ Linh sinh ngày 4/4/1959 tại Hưng Yên. Bà có trình độ Thạc sỹ Quy hoạch đô thị - Kiến trúc sư.
Trước khi trở thành Thứ trưởng Bộ Xây dựng, bà đã có thời gian dài làm việc tại các doanh nghiệp thuộc Bộ Xây dựng.
Năm 2006, khi đang là Giám đốc Công ty Tư vấn thiết kế xây dựng, bà được bổ nhiệm làm Vụ trưởng Vụ Kiến trúc Quy hoạch Xây dựng thuộc Bộ Xây dựng.
Tháng 2/2012, bà được Bổ nhiệm làm Cục trưởng Cục Phát triển đô thị.
5 tháng sau, tháng 7/2012, bà được bổ nhiệm làm Thứ trưởng Bộ Xây dựng cho đến nay.
