Trước đó, từ tháng 9/2016, Công an tỉnh Phú Yên đã khởi tố bị can đối với ông Võ Tân - giám đốc và ông Dương Sơn Hoan - kế toán trưởng Công ty Cổ phần Công nghiệp nông thủy sản Phú Yên. Cả hai người đều bị khởi tố về tội cố ý làm trái quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng.
Theo cơ quan Công an, năm 2007, ông Võ Tân lập tờ trình xin Tập đoàn Vinashin chủ trương cho phép Công nghiệp nông thủy sản Phú Yên được đầu tư đội 4 tàu vận tải biển.
Ngày 22/10/2007, HĐQT Vinashin cho phép Công ty Cổ phần Công nghiệp nông thủy sản Phú Yên lập dự án đầu tư đóng mới hai tàu vận tải biển có trọng tải 4.000 tấn với tổng mức đầu tư dự tính là 150 tỷ đồng.
Tuy nhiên, cũng trong ngày này, ông Võ Tân đã lập tờ trình đề nghị xin khởi công đóng hai tàu trọng tải 4.000 tấn và ông Phạm Thanh Bình đã phê chuẩn đề nghị này.
Hậu quả của việc làm tắt, không chấp hành các quy định nhà nước trong đầu tư này đã gây thiệt hại nghiêm trọng về kinh tế, ở mức hơn 5 tỷ đồng - theo các cơ quan giám định chuyên ngành của tỉnh Phú Yên.