Theo đó, sau hơn 4 tháng điều tra, căn cứ chứng cứ, lời khai của các bị can, Cơ quan CSĐT Công an Đà Nẵng đã có kết luận điều tra đối với vụ án chìm tàu du lịch Thảo Vân 02 trên sông Hàn xảy ra vào tối ngày 4/6/2016.
Cụ thể, bị can Lê Công Chí (SN 1975, trú tổ 39 phường An Hải Bắc, quận Sơn Trà, Đà Nẵng), thuyền trưởng tàu du lịch Thảo Vân 02 bị đề nghị truy tố tội: “vi phạm quy định về điều khiển phương tiện giao thông đường thủy” gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng theo khoản 3 Điều 212 Bộ luật Hình sự, với mức hình phạt từ 7-15 năm tù
Bị can Lê Công Chí đã điều khiển tàu Thảo Vân 02 (số hiệu ĐN0016) chở vượt quá số lượng người cho phép; không kiểm tra điều kiện an toàn đối với người và phương tiện... nên gây lật tàu làm 56 người rơi xuống sông, khiến 3 người, 4 người bị thương với tỉ lệ thương tích từ 11-12% (tổng tỉ lệ thương tích là 45%), trong có 2 người nước ngoài. Đồng thời gây thiệt hại về tài sản của 28 nạn nhân lên đến 616,4 triệu đồng.
Bị can Võ Quốc Hùng (SN 1972, quê quán ở Thăng Bình, Quảng Nam, trú 162 Trần Phú, quận Hải Châu, Đà Nẵng), là chủ Doanh nghiệp tư nhân Du thuyền Thảo Vân và Nguyễn Ngọc Quân (SN 1981 tại Hà Nội, trú cùng địa chỉ bị can Võ Quốc Hùng), là nhân viên quản lý tàu du lịch Thảo Vân 02 cùng bị truy tố về tội: “đưa vào sử dụng các phương tiện giao thông đường thủy không đảm bảo an toàn” gây hậu quả đặc biệt nghiêm trọng, theo khoản 3 Điều 214 Bộ luật Hình sự với mức phạt từ 7-15 năm tù.
Mặc dù không đủ điều kiện kinh doanh, nhưng bị can Võ Quốc Hùng đã đưa tàu Thảo Vân 02 vào hoạt động không đúng công dụng; chở khách sai quy định; không bố trí đủ định biên cho tàu chở 28 người, chỉ có 01 người vừa làm thuyền trưởng, vừa lái tàu, vừa làm thợ máy; nhân viên phục vụ trên tàu không có thẻ thuyền viên, không được tập huấn về chuyên môn nghiệp vụ vận tải du lịch; không đăng ký bến bãi cho tàu Thảo Vân 02; hoạt động bất hợp pháp;...
Bị can Lê Sáu (SN 1975, quê quán ở Đồng Hới, Quảng Bình; trú tại 39 Thanh Hải, phường Thanh Bình, quận Hải Châu, Đà Nẵng), là Giám đốc Cảng vụ đường thủy nội địa Đà Nẵng, bị truy tố tội "thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng” quy định tại khoản 2 Điều 285 Bộ luật Hình sự với mức án phạt từ 3-12 năm tù khi để tàu Thảo Vân 02 hoạt động trái phép từ năm 2015 cho đến khi xảy ra sự việc.
Trước đó, liên quan đến vụ chìm tàu Thảo Vân 02, Ủy ban kiểm tra Thành ủy Đà Nẵng đã kỷ luật khiển trách đối với Phó Giám đốc Sở GTVT Đà Nẵng chuyên trách, vì đã thiếu kiểm tra cấp dưới trong việc chấp hành các quy định về đảm bảo an toàn hoạt động đường thủy nội địa; không cương quyết trong chỉ đạo di chuyển các tàu về neo đậu đúng nơi quy định, để tàu Thảo Vân 2 không đủ điều kiện hoạt động vẫn chở hành khách xuất bến, dẫn đến tàu bị lật và chìm, gây hậu quả nghiêm trọng.
Hiện cơ quan CSĐT Công an Đà Nẵng đang hoàn tất hồ sơ, chuyển vụ án qua Viện KSND TP Đà Nẵng để tiến hành các thủ tục đưa ra xét xử theo luật định.